Importancia de las coinfecciones de SARS-CoV-2 con agentes virales asociados a infecciones respiratorias

En Colombia, la IRA es un evento de importancia en salud pública debido a que es la quinta causa de mortalidad en población general, para el año 2019 el INS notificó más de 5.000.000 de consultas asociadas a este tipo de infecciones, las cuales incrementan de mayo a junio (1). Para el año 2020, el país afrontó la llegada del virus Sars-Cov-2, el cual hasta el momento ha dejado 2,226,262 casos y 58,834 muertes en el país, y se convirtió en el evento de mayor relevancia para la salud pública a nivel nacional, sin embargo, se debe considerar que la coinfección de Sars-Cov-2 con otros virus respiratorios pueden generar complicaciones en los pacientes.

Se ha reportado que los virus de la Influenza A, Influenza B y el Virus Sincitial Respiratorio (VSR) se presentan como los agentes virales más comunes en las coinfecciones con SARS-CoV-2 (2-4), los cuales presentan síntomas y hallazgos de laboratorio similares (5), pero en algunos casos se pueden asociar niveles elevados de Procalcitonina a una coinfección con estos agentes en pacientes con neumonías complicadas (6), también se ha encontrado que, en pacientes con comorbilidades como obesidad, hipertensión y diabetes, la presencia de coinfecciones están asociadas a mayor riesgo de gravedad de la enfermedad (7). Debido a la reducción significativa de linfocitos que se observa en los pacientes con infección por SARS-CoV-2, causada por el aumento de citocinas proinflamatorias, se genera un estado de inmunosupresión en los pacientes que los hace más susceptibles a una coinfección con otros patógenos (8).

En algunos estudios se ha evidenciado que agentes como la Influenza A puede interferir con el diagnóstico temprano de SARS-CoV-2, generando falsos negativos (9) y, debido a que los antiguos paneles de detección de agentes respiratorios no incluyen la identificación de SARS-CoV-2, no es posible hacer una discriminación en simultaneo de coinfecciones de SARS-CoV-2 con otros patógenos virales que causen infecciones respiratorias; dada esta necesidad, Seegene presenta su nuevo kit Allplex™ SARS-CoV-2/Flu A/Flu B/RSV, este es un ensayo de PCR multiplex en tiempo real diseñado para detectar los genes N, RdRP y S para SARS-CoV-2, Influenza A, Influenza B y Virus Sincitial Respiratorio (RSV) A/B en una sola reacción, asegurando una alta sensibilidad y especificidad, el kit incluye la detección de un control interno endógeno y exógeno para hacer la validación del proceso desde la obtención de la muestra hasta la extracción, amplificación y generación de resultados, los cuales son interpretados automáticamente por el software Seegene Viewer, asegurando un resultado preciso que garantiza el manejo adecuado de los pacientes con posibles coinfecciones por agentes virales de importancia clínica en el país.

• Bibliografía

1. Boletín epidemiológico semanal, Instituto Nacional de Salud, Semana epidemiológica 40 29 de sep. al 5 de octubre de 2019
2. Khodamoradi, Z., Moghadami, M., & Lotfi, M. (2020). Co-infection of Coronavirus Disease 2019 and Influenza A: A Report from Iran. Archives of Iranian Medicine, 23(4), 239-243. https://doi.org/10.34172/aim.2020.04
3. Shupeng Jiang, Panpan Liu, Ge Xiong, Zhaohui Yang, Ming Wang, Yan Li and Xue-jie Yu Coinfection of SARS-CoV-2 and multiple respiratory pathogens in children De Gruyter | 2020 DOI: https://doi.org/10.1515/cclm-2020-0434
4. Calcagno, A., Ghisetti, V., Burdino, E., Trunfio, M., Allice, T., Boglione, L., Bonora, S., & Di Perri, G. (2021). Co-infection with other respiratory pathogens in COVID-19 patients. Clinical Microbiology and Infection, 27(2), 297-298. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2020.08.012
5. Kondo, Y., Miyazaki, S., Yamashita, R., & Ikeda, T. (2020). Coinfection with SARS-CoV-2 and influenza A virus. BMJ Case Reports, 13(7), e236812. https://doi.org/10.1136/bcr-2020-236812
6. Tang, M.-L., Li, Y.-Q., Chen, X., Lin, H., Jiang, Z.-C., Gu, D.-L., Chen, X., Tang, C.-X., & Xie, Z.-Q. (2021). Co-Infection with Common Respiratory Pathogens and SARS-CoV-2 in Patients with COVID-19 Pneumonia and Laboratory Biochemistry Findings: A Retrospective Cross-Sectional Study of 78 Patients from a Single Center in China. Medical Science Monitor : International Medical Journal of Experimental and Clinical Research, 27, e929783-1-e929783-8. https://doi.org/10.12659/MSM.929783
7. Vargas-Ponce, K. G., Salas-López, J. A., Llanos-Tejada, F. K., Morales-Avalos, A., Vargas-Ponce, K. G., Salas-López, J. A., Llanos-Tejada, F. K., & Morales-Avalos, A. (2020). Coinfección de COVID-19 e influenza: Reporte de cinco casos en un hospital peruano. Revista de la Facultad de Medicina Humana, 20(4), 738-742. https://doi.org/10.25176/rfmh.v20i4.3158
8. Li, Z., Chen, Z.-M., Chen, L.-D., Zhan, Y.-Q., Li, S.-Q., Cheng, J., Zhu, A.-R., Chen, L.-Y., Zhong, N.-S., Li, S.-Y., Lu, W.-J., & Ye, F. (2020). Coinfection with SARS-CoV-2 and other respiratory pathogens in patients with COVID-19 in Guangzhou, China. Journal of Medical Virology, 92(11), 2381-2383. https://doi.org/10.1002/jmv.26073
9. Lai, C.-C., Wang, C.-Y., & Hsueh, P.-R. (2020). Co-infections among patients with COVID-19: The need for combination therapy with non-anti-SARS-CoV-2 agents? Journal of Microbiology, Immunology and Infection, 53(4), 505-512. https://doi.org/10.1016/j.jmii.2020.05.013